Ochrona lasu polega ona przede wszystkim na podejmowaniu działań profilaktycznych w zakresie ochrony stanu zdrowotnego lasu i małej retencji wodnej, co jest ważne ze względu na zagrożenie od:

• pożarów
• szkodników owadzich
• grzybów
• zwierzyny
• czynników abiotycznych

W ramach profilaktyki przeciwpożarowej Nadleśnictwo Lipka dba o:
mineralizację pasów p-poż, utrzymanie dróg dojazdowych do punktów czerpania wody, stały kontakt z sąsiednimi nadleśnictwami oraz rejonowymi OSP, sprawne działanie Punktu Alarmowo-Dyspozycyjnego, monitoring terenu Nadleśnictwa za pomocą kamer telewizyjnych umieszczonych na dwóch wieżach obserwacyjnych

Ochrona przed owadami polega na:

• prowadzeniu zabiegów gospodarczych, tj. czyszczenia i trzebieże (zabieg uzależniony od wieku drzewostanu), aby utrzymać las stabilny i zdrowy
• przestrzeganiu terminowego wywozu drewna w okresie letnim, aby owady zasiedlające pozyskane drewno nie zdążyły wylecieć i zasiedlić innych drzew
• usuwaniu posuszu czynnego
• prowadzeniu profilaktycznych jesiennych poszukiwań owadów w ściole pod okapem drzewostanu (po pierwszych przymrozkach)
• stałym monitoringu wszystkich drzewostanów od wiosny do jesieni, głównie     w okresie rójki kilkunastu szczególnie groźnych gatunków owadów
• w przypadku gradacji – wykonaniu oprysków z powietrza przy wykorzystaniu samolotów, usuwaniu zasiedlonych drzew i wywożeniu ich najszybszym możliwym terminie

Jako miejsce życia wielu gatunków zwierząt las jest narażony (głównie w młodym wieku) na skutki ich bytowania:

• zadeptywanie (odnowienia),
• ścinanie i zgryzanie (pędów młodych drzew w uprawach),
• spałowanie (młodniki)

Zabezpieczeniem, które przynosi pożądane skutki jest gównie grodzenie upraw. Stosuje się również smarowanie pędów i strzałek środkami chemicznymi, palikowanie i zakładanie osłonek na pędy Zwierzyna podczas żerowania na młodszych drzewach, negatywnie wpływa na wzrost i rozwój drzew, doprowadzając czasami nawet do ich śmierci.